新疆借助于现在稳定的环境，开始召集内地民众，进新疆开荒，以军团编制进行管理。
在受到战争危害的重灾省发布内容详细的垦荒令。内地受到战争破坏的难民，疯狂涌入宁夏，甘肃等地。几个汽车团日夜运送，将内地难民，送往垦荒地点。已基地模式进行管理。
难民们有点能力的滞留甘宁两省，补充民众。没有能力的由当地政府组织送近新疆。一时新疆涌进数十万人口，吴兆华省长赶紧去陕甘宁边区和四川湖南等地购粮，用钱买，用物换，中央秘密调配，总算筹集到足够的粮食，能维持到垦荒的粮食下来之后。
难民们由战士们分片包干，组成各排连，一营一地，一团一片，一师一面，一个军负责一方。难民登记造册，各地集中安排，互相寻找熟悉的同村，同乡，亲人由特勤组一组负责登记审查，没有人认识的走散的难民由专门的特勤二组进行审查。难民是多，可我党的党员和忠诚革命的战士更多，组织起庞大的特勤审查组，很轻松。避免了混在难民中的日伪顽敌特份子搞破坏。在粮食快要丰收的时候，成立民兵组织，儿童团，对粮田进行24小时守护。
在战士们日思夜想奔赴抗日战场的时候，119师第一团，在团长贺强的带领下，进入新疆进行休整，替换第二军一个师，第二军随即大比武，选出成绩优异的第三师赶赴抗日战场。第三师的官兵兴奋异常，嗷嗷的叫着立刻去战场参战，师长更是找到三个汽车团的团长，请客喝酒；汽车团的团长知道他们是去抗日战场的，还吃喝什么，命令手下检查车况，加满汽油，带够储备油料，连夜拉着第三师开拔。用几个团长的话，如果油料允许，直接送你们去消灭小鬼子的前沿阵地。
吴兆华领导的新疆政府将整个新疆分为哈密，库尔勒，吐鲁番，伊宁，阿勒泰，阿克苏，阿图什，和田，博乐，塔城10个农垦兵团，实行军事化管理，其中塔城，伊宁，阿勒泰，和田为副军级规模农垦兵团，其他为副师级规模农垦兵团。
农垦兵团建立学校，后勤，保卫等管理部门，在兵团里实行会宁模式发展，壮大农垦事业，巩固，提高兵团的自身防卫力量。
在难民中吸收工农子弟进入红军队伍，扩充部队，新疆地区驻扎正规主力部队红三方面军红二军，骑兵军。两军兵力庞大，吴兆华在请示总指挥之后，以红二军，骑兵军为基干，组建新疆第一军，第二军，第三军，骑兵第一军，第二军，第三军。
其中以原红二军为基础组建的新疆第一军驻扎乌鲁木齐负责吐鲁番，库尔勒地区，第二军驻扎伊尔负责伊尔博乐地区，第三军驻扎塔城地区，骑兵第一军驻扎阿勒泰地区训练管理副军级农垦兵团，并行实行军垦，军牧，骑二军驻扎哈密负责哈密地区；骑三军驻扎阿图什负责阿图什，阿克苏，和田地区训练管理副师级农垦兵团，同时要求驻扎各部队负责协助当地党政军各项建设，大力发展农垦战士，地区民兵，实行全员军事化管理。
在等待开荒的日子里，部队各连排下放农垦兵团各个农场，组织青壮男子组成民兵连，进行训练。妇女们用部队下发的棉布衣料赶制军装棉服，送往抗日前线；又为她们购买了大量的牛和羊，放养。
吴兆华在团以上军官大会上，发言。
同志们，我们要把建设农垦兵团提升到战略高度，全力发展全疆农垦兵团建设，生产出大量的粮食供给抗日前线的作战部队，生产出大量的粮食来周济难民；日本的侵华战争不可能短时间结束，我国地无人种植，人得不到几口吃食，这样的局面会持续很长时间；说句好听点的话，我们农垦兵团打下的粮食要挽救半个中国的人民，同志们，你们说，农垦兵团光荣不？
光荣，底下的红军将官们高声回应。
我们在大力种植粮食，大力畜牧的时候，千万不要忘记培养训练农垦战士，农垦战士将是地方部队的兵员，地方部队呢，就是在座各位所指挥的主力部队的兵员，要高度重视起来，咱们现在有27万农垦战士，就有27万红军战士；将来有100万农垦战士，就会有100万红军战士，拿就是百万农垦百万兵，同志们，到了那个时候，我们还怕谁哩！是不是啊？
是，底下齐声喊道，热烈回应台上吴兆华的讲话。
所以啊，同志们，回去以后要把农垦兵团的各个农场工作认真抓起来，要把农产建设好战士培训好；我是要检查农场的，也是要比武的；不但全军大比武，农垦战士也要比武，地方部队也要比武，优秀者光荣，落后者追赶；你们有没有信心把农垦战士训练成地方部队，把地方部队训练成主力部队，有没有？
有！有！有！底下的将官们发动起来了，各个要跃跃欲试，立即赶回去规划，建设农场，训练农垦战士。
同志们，不要着急，好刀不是一锤子就能砸出来的；你们要用通道模式耐心的教育每一个农场战士，要关心，爱护他们，使他们能自觉的成长为坚定的革命战士；你们是怎么受到总指挥的教育成长起来的，就怎么教育广大农垦战士，不要强行，强逼农垦战士训练，如果被发现，你的好日子也到头了，我会严惩不贷，都记住了么？
记住了。
下面请政委，参谋长讲话。
嘿嘿，老吴，你比我更像总指挥，看你说话的样子派头，十足的总指挥模样，啊哈哈哈哈
好你个老宋，这回说起我来了，一会罚你三百杯。
会议结束后，每一位与会的同志都深受教育，深受鼓舞，感觉到身上责任之重大。回到农场后，上午组织学习，训练，考试合格后发军装，农垦战士你追我赶面貌一新。下午开挖沟渠粗道，待土开化时，再细细修整，做好春耕之前的所有准备工作。工厂生产出来的拖拉机从北向南逐个分配给各个农场，宋希东参谋长开始谋求更多的生产线了。只要有难民进入，就会有接收单位，就会被安置，就会有部门提供基本的生活保障，就会有人为他们以后的活路奔波。
一切全靠资金和物质的运转，如果没有陕甘宁的支持，没有矿产资源的支持，很难会有这样的开局。